Prüfung
BTU-Vorlesungsverzeichnis ↗- Donnerstag18 Mär 202709:00 bis 11:00
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12736Fakultät 2 – Umwelt und Naturwissenschaften
Bioinformatik
Titel auf Englisch: Bioinformatics
Lernergebnisse
Da die Molekularbiologie immer mehr von der Bioinformatik abhängig ist, liefert dieses Modul auch grundlegende Informationen über die Nutzung von Datenbanken und die webbasierten Werkzeuge, die für die Suche und Extraktion der relevanten Informationen notwendig sind (Sequenzen, Proteinstrukturen, genomische Informationen, tägliche Anforderungen des molekularbiologischen Labors). Kompetenzen: Kenntnisse der molekularbiologischen Nomenklatur. Ein grundlegendes Verständnis der wichtigsten Gen- und Proteinfunktionen. Verständnis der Konzepte molekularbiologischer Experimente (Klonierungs- und Expressionssysteme, Erzeugung von Fusionsproteinen, Reportergene, Konstruktion künstlicher Gene, Mutagenese in-vitro und in-vivo). Grundkenntnisse molekularbiologischer Analyseverfahren (Sequenzierung, Microarray, Real-Time PCR, genomweite Analyse von RNA und DNA). Die Fähigkeit, publizierte Daten und Konzepte in peer-reviewed Journals zu verstehen und zu interpretieren. Ein großes Anliegen ist es, die Interdisziplinarität der Molekularbiologie hervorzuheben, die fast alle Aspekte der Biologie, Biochemie und Medizin beeinflusst. Kenntnisse über die wichtigsten webbasierten Werkzeuge der Bioinformatik und deren Anwendbarkeit auf "alltägliche" molekularbiologische Aufgaben wie Datenbanksuche, Sequenzvergleich, Proteinstruktur-Funktionsbeziehung, Homologieanalyse. Ein allgemeines Verständnis des Begriffs “Datenbank”.
Inhalte
Die Vorlesung Bioinformatik wird von einem „Hands-on“-Kurs begleitet, in dem die Bioinformatik-Werkzeuge zu „alltäglichen molekularbiologischen Problemen“ eingesetzt werden. Web-basierte Programme und deren Algorithmen wie NCBI's (psi)BLAST, BRENDA, Pfam, ClustalW2, ScanProsite, UniProt und andere werden während der Vorlesung erklärt und von den Studenten genutzt, um Probleme zu lösen, auf die sie bei ihrer eigenen Laborarbeit stoßen könnten. Die Programmiersprache R, Bildverarbeitungssoftware und weitere Tools/Methoden (z. B. JSON, LaTeX, Markdown, Quarto) werden eingeführt. Der Lernprozess wird durch „echte Bioinformatik-Probleme“ ergänzt, die in den „Hands-on“-Übungen mit den beschriebenen und in der Vorlesung praktisch angewandten Programmen gelöst werden. Am Ende des Moduls sind die Studierenden in der Lage, sich relevante Softwarepakete zu merken und die zu lösenden Probleme zu verstehen. Sie sind in der Lage, das am besten geeignete Programm für ihre eigenen Experimente anzuwenden. Sie können die gewonnenen Daten analysieren und auswerten und sollten in der Lage sein, verschiedene neue Ansätze für die Arbeit im Bereich der Bioinformatik zu entwickeln.
Voraussetzungen
Verpflichtende Voraussetzungen
Keine
Empfohlene Voraussetzungen
Keine
Prüfungsmodalitäten
Schriftliche Prüfung 120 min.
Termine im WiSe 26/27
Die einzigen Termine im WiSe 26/27 sind Prüfungstermine – gelehrt wird das Modul in diesem Semester nicht.
Angeboten in
- BiotechnologieBachelor
Wahlpflichtkomplex: Kein Komplex genannt
| Studiengang | Abschluss | Wahlpflichtkomplex |
|---|---|---|
| Biotechnologie | Bachelor | Kein Komplex genannt |
Literatur und Materialien
Programme der führenden Bioinformatik-Organisationen im WWW
Hinweise
Die Lehrveranstaltungen (Vorlesung und Seminar) finden als Blockveranstaltung statt. Die Prüfung findet am Campus Senftenberg (gegebenenfalls am PC des Computer-Kabinetts) statt
Bewertungen von Studierenden
Was Studierende über dieses Modul sagen. Die BTU hat damit nichts zu tun — hier schreiben nur Studierende, und jede Bewertung ist die Meinung einer einzelnen Person.